Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP17L4A6NCW7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP17L4A6NCW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms