Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNF222A6NCQ9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms