Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
TDRD12Q587J7 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms