Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC016027.2-201ENST00000441167 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTPREP23469 LARGE-AS1-203ENST00000438159 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AL355916.1-202ENST00000508827 5103 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 LINC02431-202ENST00000505329 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
PTPREP23469 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL445235.1-201ENST00000431202 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TNFSF15-201ENST00000374044 2789 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTPREP23469 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTPREP23469 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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