Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZNF300-204ENST00000427179 4155 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PRDX6-201ENST00000340385 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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