Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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RAB6CQ53S08 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RAB6CQ53S08 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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