Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CPM-211ENST00000551568 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CHD7-203ENST00000525508 4777 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MYO6-203ENST00000369981 8692 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 EDA-213ENST00000616899 4643 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LRP2BP-201ENST00000328559 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PLEKHA5-213ENST00000538714 6487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FN1-212ENST00000446046 7952 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MARF1-201ENST00000396368 7743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
RYR3Q15413 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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