Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
CACNA1SQ13698 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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