Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC020636.1-201ENST00000469268 565 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC139085.1-201ENST00000582716 182 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC008522.1-201ENST00000639479 2906 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FGFR2-206ENST00000358487 4255 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FAM126A-202ENST00000409923 3130 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC100771.2-201ENST00000525833 1350 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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MKRN3Q13064 SPP1-201ENST00000237623 1581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 ZNF546-207ENST00000600094 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPS27-202ENST00000392558 625 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 HMGN1P34-201ENST00000413023 290 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AL157714.2-204ENST00000452283 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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MKRN3Q13064 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CEACAMP3-202ENST00000483806 638 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 OR4A7P-201ENST00000531463 910 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 AC069360.1-202ENST00000533941 557 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
MKRN3Q13064 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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