Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CENPFP49454 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 RSL1D1-204ENST00000571133 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CENPFP49454 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CENPFP49454 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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