Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SCN11AQ9UI33 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
SCN11AQ9UI33 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms