Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CACNA1SQ13698 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
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