Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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FOXC1Q12948 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 NUSAP1-212ENST00000560747 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
FOXC1Q12948 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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