Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ACACA-232ENST00000614438 569 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 UNC5D-206ENST00000453357 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 SERPINB4-201ENST00000341074 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC021683.2-203ENST00000591283 4902 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
PTPREP23469 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 PRDM10-205ENST00000526082 3308 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
PTPREP23469 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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PTPREP23469 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 HEPACAM2-202ENST00000394468 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 NVL-212ENST00000469968 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 A2ML1-AS2-201ENST00000394240 386 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTPREP23469 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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