Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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CHD4Q14839 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CHD4Q14839 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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