Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TMCC1-202ENST00000426664 5484 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
BPTFQ12830 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms