Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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ACTBP60709 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ACTBP60709 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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