Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AP003721.1-201ENST00000543907 864 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 PCED1B-AS1-207ENST00000551432 522 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01588-211ENST00000556434 892 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 FREM1-203ENST00000380894 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RRN3-201ENST00000198767 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00558-201ENST00000569422 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC002480.4-201ENST00000414116 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IDI2-201ENST00000277517 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GJB2-201ENST00000382844 2309 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ADGRF4-202ENST00000327753 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 GOSR2-234ENST00000640138 3408 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 C2CD3-201ENST00000313663 6283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 SIMC1-201ENST00000332772 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 KBTBD4-204ENST00000526005 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IKZF3-207ENST00000377944 1669 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IKZF3-208ENST00000377945 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MAATS1-201ENST00000273390 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZNF619-210ENST00000522736 2030 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NIM1K-204ENST00000512796 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR1J2-201ENST00000335302 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MKRN3Q13064 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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