Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 IGKV6D-41-201ENST00000390271 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
IFFO1Q0D2I5 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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