Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
NBNO60934 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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NBNO60934 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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NBNO60934 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
NBNO60934 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
NBNO60934 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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