Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
APOC4-APOC2K7ER74 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
APOC4-APOC2K7ER74 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms