Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HCG18-240ENST00000454269 2430 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AP2B1-213ENST00000612116 3483 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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FOXQ1Q9C009 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
FOXQ1Q9C009 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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