Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CSGALNACT1-203ENST00000454498 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SLC25A16-207ENST00000609923 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ZNF726-206ENST00000594466 2473 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 TCF20-201ENST00000335626 6237 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0D2-201ENST00000285393 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PDE1A-203ENST00000409365 2034 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 HCAR1-201ENST00000432564 4768 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 DDX3X-217ENST00000629496 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 KIF23-207ENST00000559279 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 MTHFD1-201ENST00000216605 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 NFASC-201ENST00000339876 10333 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 GAPVD1-204ENST00000394083 4747 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 MLANA-203ENST00000381477 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 LCP2-210ENST00000628092 2421 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ZFP30-202ENST00000392144 3916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL162311.2-201ENST00000550416 709 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC010266.1-201ENST00000568962 442 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PPFIA2-204ENST00000541017 4192 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CYB561A3-221ENST00000546151 3986 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 AC104806.2-201ENST00000502400 1991 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PCDH9-204ENST00000544246 6234 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC6B-202ENST00000347691 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 YIPF5-201ENST00000274496 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SEPSECS-202ENST00000382103 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 PHACTR1-201ENST00000332995 5332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 DAZL-202ENST00000399444 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 MICB-204ENST00000538442 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SGIP1Q9BQI5 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms