Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF776-201ENST00000317178 5292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MID1-203ENST00000380780 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ZAN-206ENST00000618565 8651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 DNMBP-204ENST00000636706 5437 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 THSD7B-203ENST00000413152 5846 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
LAMA3Q16787 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms