Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
CACNA1SQ13698 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LPP-208ENST00000448637 5835 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CACNA1SQ13698 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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