Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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PGGT1BP53609 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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PGGT1BP53609 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PGGT1BP53609 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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