Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ARID1B-232ENST00000637904 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 EXOC5-211ENST00000621441 10589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CENPFP49454 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CENPFP49454 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 BCOR-205ENST00000397354 6258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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CENPFP49454 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CENPFP49454 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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