Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
GRIK4Q16099 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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