Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ADH7-201ENST00000209665 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR10W1-201ENST00000395079 1469 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DUSP22-216ENST00000605863 551 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 SP140-205ENST00000420434 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF878-201ENST00000547628 1734 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 UBXN8-201ENST00000265616 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 FHL1-217ENST00000539015 2310 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC85BQ15834 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms