Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC01788-201ENST00000419450 2086 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RASSF6-201ENST00000307439 5994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIAA0513-206ENST00000566428 7772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ICA1L-222ENST00000617388 8151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 TRERF1-204ENST00000372922 7286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HERC1Q15751 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
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