Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPN13Q12923 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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