Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
MCAMP43121 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms