Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 UCK2-206ENST00000470820 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FDPSP3-201ENST00000556903 1013 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC009118.1-201ENST00000566019 374 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL606760.4-201ENST00000617613 718 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC013470.2-202ENST00000635746 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 BBS9-203ENST00000355070 4004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PTPRM-202ENST00000400053 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR8D4-202ENST00000641687 2904 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF2-204ENST00000617923 3885 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC096745.2-201ENST00000627783 1914 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC110926.1-201ENST00000412499 2825 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 WEE2-AS1-206ENST00000478332 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB43-203ENST00000449886 5851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNASEH2B-AS1-209ENST00000631080 1707 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR10J3-201ENST00000332217 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CARD17-201ENST00000375707 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MIR106B-201ENST00000385301 82 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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TRIM35Q9UPQ4 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC244502.1-205ENST00000535351 571 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC016629.2-201ENST00000597341 199 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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TRIM35Q9UPQ4 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF200-201ENST00000396868 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 STXBP5L-205ENST00000472879 3067 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 VSIG1-202ENST00000415430 3236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 FAM122C-211ENST00000623326 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TRIM35Q9UPQ4 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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