Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL365217.1-201ENST00000398578 2436 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL12-202ENST00000367259 2257 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 BNIPL-203ENST00000368931 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 STRADA-241ENST00000639835 2130 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CRP-201ENST00000255030 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF3-204ENST00000405493 5751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCA4-207ENST00000536513 3740 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RHPN2-201ENST00000254260 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC39A9-201ENST00000031146 5192 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01140-206ENST00000484933 3368 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRC5-203ENST00000436936 6724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF611-219ENST00000602162 3299 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LRGUK-201ENST00000285928 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RPH3A-219ENST00000551052 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL357054.4-201ENST00000606285 2814 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CEP41-201ENST00000223208 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 OBP2B-201ENST00000372032 702 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 DEFA1-201ENST00000382679 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR200B-201ENST00000384997 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 PGAM1P4-201ENST00000397343 750 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPT-207ENST00000420682 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL021707.4-201ENST00000423346 410 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL050331.1-201ENST00000435100 623 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 CLUHP5-201ENST00000438421 774 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 AL590648.3-201ENST00000446962 473 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.6 ms