Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
TRAPPC9Q96Q05 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms