Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CLDN19Q8N6F1 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLDN19Q8N6F1 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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