Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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CCDC93Q567U6 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CCDC93Q567U6 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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