Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ATMIN-206ENST00000566488 5343 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
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