Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
CENPFP49454 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 EFCAB6-203ENST00000396231 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CENPFP49454 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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CENPFP49454 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CENPFP49454 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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