Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TIAM2-202ENST00000318981 5916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ICOSLG-204ENST00000407780 7080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LRRC37A4P-202ENST00000581296 5372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 VCPIP1-201ENST00000310421 9942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PCYT1B-203ENST00000379145 5307 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 DDX52-213ENST00000617633 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RYR3Q15413 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 TMCC1-201ENST00000393238 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RYR3Q15413 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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