Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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ITGA9Q13797 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ITGA9Q13797 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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