Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01808-203ENST00000641932 1643 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HLA-DMAP28067 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms