Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 VIL1-201ENST00000248444 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ANLN-201ENST00000265748 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 STAMBP-202ENST00000394070 6691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MYH8-201ENST00000403437 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PKHD1P08F94 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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