Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DCP2-208ENST00000515408 8029 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IL13RA2-202ENST00000371936 1498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CACNA1E-206ENST00000367573 7067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 TRPM1-201ENST00000256552 5514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ZSCAN31-203ENST00000414429 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 CDH11-202ENST00000394156 6874 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HERC1Q15751 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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