Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
SS18Q15532 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
SS18Q15532 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms