Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CDH18Q13634 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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CDH18Q13634 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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CDH18Q13634 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CDH18Q13634 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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