Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U3KQK5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
U3KQK5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
U3KQK5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQK5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
U3KQK5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms