Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MINOS1-NBL1R4GNA1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms