Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SETBP1Q9Y6X0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETBP1Q9Y6X0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms