Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms